| 学名 | 和名 |
| Abelia spathulata Siebold et Zucc. var. spathulata | ツクバネウツギ |
| Abelia x grandiflora (Rovelli ex André) Rehder | ハナゾノツクバネウツギ |
| Abeliophyllum distichum Nakai | ウチワノキ |
| Abies firma Siebold et Zucc. | モミ |
| Abies homolepis Siebold et Zucc. | ウラジロモミ |
| Abies veitchii Lindl. | シラビソ |
| Acer amoenum Carrière var. matsumurae (Koidz.) K.Ogata | ヤマモミジ |
| Acer buergerianum Miq. | トウカエデ |
| Acer carpinifolium Siebold et Zucc. | チドリノキ |
| Acer cissifolium (Siebold et Zucc.) K.Koch | ミツデカエデ |
| Acer ginnala Maxim. var. aidzuense (Franch.) Pax | カラコギカエデ |
| Acer insulare Makino | シマウリカエデ |
| Acer japonicum Thunb. | ハウチワカエデ |
| Acer negundo L. | トネリコバノカエデ |
| Acer nipponicum H.Hara subsp. nipponicum var. nipponicum | テツカエデ |
| Acer palmatum Thunb. | イロハモミジ |
| Acer pictum Thunb. | イタヤカエデ |
| Acer pycnanthum K.Koch | ハナノキ |
| Acer rubrum L. | アメリカハナノキ |
| Acer rufinerve Siebold et Zucc. | ウリハダカエデ |
| Acer shirasawanum Koidz. | オオイタヤメイゲツ |
| Acer sieboldianum Miq. | コハウチワカエデ |
| Acer tenuifolium (Koidz.) Koidz. | ヒナウチワカエデ |
| Acer truncatum Bunge | マンシュウイタヤ |
| Acer tschonoskii Maxim. | ミネカエデ |
| Actinidia arguta (Siebold et Zucc.) Planch. ex Miq. | サルナシ |
| Actinidia polygama (Siebold et Zucc.) Planch. ex Maxim. | マタタビ |
| Actinodaphne acuminata (Blume) Meisn. | バリバリノキ |
| Adina pilulifera (Lam.) Franch. ex Drake | タニワタリノキ |
| Aesculus hippocastanum L. | マロニエ |
| Aesculus turbinata Blume | トチノキ |
| Agave americana L. | アオノリュウゼツラン |
| Agave atrovirens Karw. ex Salm-Dyck | サケリュウゼツラン |
| Agave striata Zucc. | - |
| Ailanthus altissima (Mill.) Swingle | ニワウルシ |
| Alangium platanifolium (Siebold et Zucc.) Harms var. trilobatum (Miq.) Ohwi | ウリノキ |
| Albizia julibrissin Durazz. | ネムノキ |
| Alnus firma Siebold et Zucc. | ヤシャブシ |
| Amelanchier asiatica (Siebold et Zucc.) Endl. ex Walp. | ザイフリボク |
| Aphananthe aspera (Thunb.) Planch. | ムクノキ |
| Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze | パラナマツ |
| Aria alnifolia (Siebold et Zucc.) Decne. | アズキナシ |
| Aria japonica Decne. | ウラジロノキ |
| Armeniaca mume (Siebold et Zucc.) de Vriese | ウメ |
| Armeniaca vulgaris Lam. var. ansu (Maxim.) T.T.Yü et L.T.Lu | アンズ |
| Aucuba japonica Thunb. var. borealis Miyabe et Kudô | ヒメアオキ |
| Aucuba japonica Thunb. var. japonica | アオキ |
| Aucuba japonica Thunb. 'Variegata' | フイリアオキ |
| Baccharis halimifolia L. | ハマベノキ |
| Bambusa multiplex (Lour.) Raeusch. ex J.A. et J.H.Schult. 'Alphonso-karr' | スホウチク |
| Bambusa multiplex (Lour.) Raeusch. ex Schult. et Schult.f. | ホウライチク |
| Berberis orthobotrys C. K. Schneid. | - |
| Berberis thunbergii DC. | メギ |
| Berberis thunbergii DC. cv. maximowiczii | メギ “マキシモーウィッチー“ |
| Berberis tschonoskyana Regel | オオバメギ |
| Betula grossa Siebold et Zucc. | ミズメ |
| Bischofia javanica Blume | アカギ |
| Broussonetia papyrifera (L.) L'Hér. ex Vent. | カジノキ |
| Buddleja curviflora Hook. et Arn. f. venenifera (Makino) T.Yamaz. | ウラジロフジウツギ |
| Buddleja japonica Hemsl. | フジウツギ |
| Butia capitata (Mart.) Becc. | ブラジルヤシ |
| Butia yatay (Mart.) Becc. | ヤタイヤシ |
| Callerya reticulata (Benth.) Schot | ムラサキナツフジ |
| Callicarpa americana L. | アメリカムラサキシキブ |
| Callicarpa dichotoma (Lour.) K.Koch | コムラサキ |
| Callicarpa giraldii Hesse ex Rehd. | - |
| Callicarpa japonica Thunb. | ムラサキシキブ |
| Callicarpa japonica Thunb. var. luxurians Rehder | オオムラサキシキブ |
| Callicarpa longifolia Lam. | - |
| Callicarpa mollis Siebold et Zucc. | ヤブムラサキ |
| Callicarpa oshimensis Hayata var. okinawensis (Nakai) Hatus. | オキナワヤブムラサキ |
| Callicarpa shikokiana Makino | トサムラサキ |
| Callistemon citrinus (Curtis) Skeels | ハナマキ |
| Callistemon linearis (Schrad. et J.C. Wendl) DC | ホソバブラシノキ |
| Callistemon speciosus (Sims) Sweet | ブラシノキ |
| Calocedrus macrolepis Kurz var. formosana (Florin) W.C.Cheng et L.K.Fu | ショウナンボク |
| Camellia japonica L. | ヤブツバキ |
| Camellia japonica L. var. macrocarpa Masam. | ヤクシマツバキ |
| Campsis grandiflora (Thunb.) K.Schum. | ノウゼンカズラ |
| Campsis radicans (L.) Seem. | アメリカノウゼンカズラ |
| Camptotheca acuminata Decne. | カンレンボク |
| Carpinus betulus | セイヨウシデ |
| Carpinus cordata Blume | サワシバ |
| Carpinus japonica Blume | クマシデ |
| Carpinus laxiflora (Siebold et Zucc.) Blume | アカシデ |
| Carpinus tschonoskii Maxim. | イヌシデ |
| Carpinus turczaninovii Hance | イワシデ |
| Carya illinoensis (Wangenh.) K.Koch | ペカン |
| Castanea crenata Siebold et Zucc. | クリ |
| Castanopsis cuspidata (Thunb.) Schottky | ツブラジイ |
| Castanopsis sieboldii (Makino) Hatus. ex T.Yamaz. et Mashiba | スダジイ |
| Casuarina cunninghamiana Miq. | カニンガムモクマオウ |
| Casuarina equisetifolia L. | トクサバモクマオウ |
| Catalpa ovata G.Don | キササゲ |
| Catalpa speciosa Warder ex Engelm. | オオアメリカキササゲ |
| Cedrus deodara (Roxb.) G.Don | ヒマラヤスギ |
| Celtis sinensis Pers. | エノキ |
| Cephalanthus occidentalis L. | アメリカタニワタリノキ |
| Cephalotaxus harringtonia (Knight ex Forbes) K.Koch 'Fastigiata' | チョウセンマキ |
| Cephalotaxus harringtonia (Knight ex Forbes) K.Koch var. harringtonia | イヌガヤ |
| Cephalotaxus harringtonia (Knight ex Forbes) K.Koch var. nana (Nakai) Rehder | ハイイヌガヤ |
| Cerasus incisa (Thunb.) Loisel. var. incisa | マメザクラ |
| Cerasus incisa (Thunb.) Loisel. var. kinkiensis (Koidz.) H.Ohba | キンキマメザクラ |
| Cerasus itosakura (Siebold) H.Ohba et S.Akiyama var. itosakura f. itosakura | イトザクラ |
| Cerasus itosakura (Siebold) Masam. et | エドヒガン |
| Cerasus jamasakura (Siebold ex Koidz.) H.Ohba | ヤマザクラ |
| Cerasus leveilleana (Koehne) H.Ohba | カスミザクラ |
| Cerasus sargentii (Rehder) H.Ohba | オオヤマザクラ |
| Cerasus serotina (Ehrh.) Loisel. | ブラックチェリー |
| Cerasus speciosa (Koidz.) H.Ohba | オオシマザクラ |
| Cerasus subhirtella (Miq.) Sokolov | コヒガンザクラ |
| Cerasus x tschonoskii (Koehne) H.Ohba | ニッコウザクラ |
| Cerasus x yedoensis (Matsum.) A.V.Vassil. 'Somei-yoshino' | ソメイヨシノ |
| Cercidiphyllum japonicum Siebold et Zucc. ex Hoffm. et Schult. | カツラ |
| Cercidiphyllum magnificum (Nakai) Nakai | ヒロハカツラ |
| Cercis chinensis Bunge | ハナズオウ |
| Cercis chinensis Bunge f. leucantha Sugim. | シロバナハナズオウ |
| Chaenomeles cathayensis (Hemsl.) C.K.Schneid. | マボケ |
| Chaenomeles japonica (Thunb.) Lindl. ex Spach | クサボケ |
| Chaenomeles speciosa (Sweet) Nakai | ボケ |
| Chamaecyparis formosensis Matsum. | ベニヒ |
| Chamaecyparis obtusa (Siebold et Zucc.) Endl. | ヒノキ |
| Chamaecyparis obtusa (Siebold et Zucc.) Endl. 'Breviramea' | カマクラヒバ |
| Chamaecyparis obtusa (Siebold et Zucc.) Endl. 'Filicoides-aurea' | オウゴンクジャクヒバ |
| Chamaecyparis obtusa (Siebold et Zucc.) Endl. 'Penduliformis' | シダレヒノキ |
| Chamaecyparis obtusa (Siebold et. Zucc.) 'Pendula' | スイリュウヒバ |
| Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Endl. | サワラ |
| Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Endl. 'Filifera' | ヒヨクヒバ |
| Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Endl. 'Plumosa' | シノブヒバ |
| Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Endl. 'Plumosa Aurea' | オウゴンシノブヒバ |
| Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Endl. 'Squarrosa' | ヒムロ |
| Chamaecyparis pisifera"Felifera Aurea" | オウゴンヒヨクヒバ |
| Chamaerops humilis L. | チャボトウジュロ |
| Chengiopanax sciadophylloides (Franch. et Sav.) C.B.Shang et J.Y.Huang | コシアブラ |
| Chimonanthus praecox (L.) Link | ロウバイ |
| Chimonobambusa marmorea (Mitford) Makino | カンチク |
| Chimonobambusa marmorea (Mitford) Makino 'Variegata' | チゴカンチク |
| Chimonobambusa quadrangularis (Franceschi) Makino | シホウチク |
| Chionanthus retusus Lindl. et Paxton | ヒトツバタゴ |
| Choenomeles speciosa (Sweet) Nakai | カンボケ |
| Choerospondias axillaris (Roxb.) B.L.Burtt et A.W.Hill | チャンチンモドキ |
| Cinnamomum camphora (L.) J.Presl | クスノキ |
| Cinnamomum cassia (L.) D.Don | トンキンニッケイ |
| Cinnamomum daphnoides Siebold et Zucc. | マルバニッケイ |
| Cinnamomum sieboldii Meisn. | ニッケイ |
| Cinnamomum yabunikkei H.Ohba | ヤブニッケイ |
| Citrus japonica Thunb. ‘Hindsii’ | キンズ |
| Citrus sphaerocarpa Y.Nakaj. ex H.Ohba | カボス |
| Citrus tachibana (Makino) Tanaka | タチバナ |
| Clethra barbinervis Siebold et Zucc. | リョウブ |
| Cleyera japonica Thunb. | サカキ |
| Cordyline australis (G.Forst.) Hook.f. | ニオイシュロラン |
| Cornus controversa Hemsl. ex Prain | ミズキ |
| Cornus florida L. | アメリカヤマボウシ |
| Cornus kousa Buerger ex Hance subsp. chinensis (Osborn) Q.Y.Xiang | ヤエヤマヤマボウシ |
| Cornus kousa Buerger ex Hance subsp. kousa | ヤマボウシ |
| Cornus macrophylla Wall. | クマノミズキ |
| Cornus mas L. | セイヨウサンシュユ |
| Cornus officinalis Siebold et Zucc. | サンシュユ |
| Cornus sanguinea L. | クレナイミズキ |
| Corylopsis gotoana Makino | コウヤミズキ |
| Corylopsis pauciflora Siebold et Zucc. | ヒュウガミズキ |
| Corylopsis spicata Siebold et Zucc. | トサミズキ |
| Corylus heterophylla Fisch. ex Besser var. thunbergii Blume | ハシバミ |
| Corylus sieboldiana Blume var. sieboldiana | ツノハシバミ |
| Cotinus coggygria Scop. | ケムリノキ |
| Cotoneaster horizontalis Decne. | ベニシタン |
| Crataegus cuneata Siebold et Zucc. | サンザシ |
| Crataegus laevigata (Poir.) DC. | セイヨウサンザシ |
| Cryptomeria japonica (L.f.) D.Don | スギ |
| Cryptomeria japonica var. aurea | オウゴンスギ |
| Cunninghamia lanceolata (Lamb.) Hook. | コウヨウザン |
| Cupressus arizonica Greene | アリゾナイトスギ |
| Cupressus lusitanica Mill. | メキシコイトスギ |
| Cupressus macrocarpa Hartw. | モントレーサイプレス |
| Cupressus sempervirens L. | ホソイトスギ |
| Cycas revoluta Thunb. | ソテツ |
| Cycas taitungensis C.F.Shen, K.D.Hill, C.H.Tsou et C.J.Chen | タイワンソテツ |
| Damnacanthus indicus C.F.Gaertn. var. indicus | アリドオシ |
| Daphniphyllum macropodum Miq. | ユズリハ |
| Daphniphyllum macropodum Miq. subsp. humile (Maxim. ex Franch. et Sav.) Hurus. | エゾユズリハ |
| Daphniphyllum teijsmannii Zoll. ex Kurz | ヒメユズリハ |
| Dasylirion leiophyllum Engelm. Ex Trel. | - |
| Dasylirion serratifolum (Karw. ex Schult. & Schult. f.) Zucc. | - |
| Davidia involucrata Baill. | ハンカチノキ |
| Dendropanax trifidus (Thunb.) Makino ex H.Hara | カクレミノ |
| Deutzia baroniana Diels | イワウツギ |
| Deutzia crenata Siebold et Zucc. | ウツギ |
| Deutzia crenata Siebold et Zucc. f. plena (Maxim.) C.K.Schneid. | サラサウツギ |
| Deutzia gracilis Siebold et Zucc. | ヒメウツギ |
| Deutzia scabra Thunb. | マルバウツギ |
| Diospyros kaki Thunb. | カキノキ |
| Diospyros lotus L. | マメガキ |
| Diospyros morrisiana Hance | トキワガキ |
| Diospyros oldhamii Maxim. | オルドガキ |
| Diospyros rhombifolia Hemsl. | ツクバネガキ |
| Disanthus cercidifolius Maxim. | マルバノキ |
| Distylium racemosum Siebold et Zucc. | イスノキ |
| Edgeworthia chrysantha Lindl. | ミツマタ |
| Ehretia acuminata R.Br. var. obovata (Lindl.) I.M.Johnst. | チシャノキ |
| Ehretia dicksonii Hance | マルバチシャノキ |
| Ehretia philippinensis A.DC. | リュウキュウチシャノキ |
| Elaeagnus glabra Thunb. | ツルグミ |
| Elaeagnus multiflora Thunb. | ナツグミ |
| Elaeagnus multiflora Thunb. var. gigantea Araki | ダイオウグミ |
| Elaeagnus multiflora Thunb. var. hortensis (Maxim.) Servett. | トウグミ |
| Elaeagnus pungens Thunb. | ナワシログミ |
| Elaeagnus umbellata Thunb. var. umbellata | アキグミ |
| Elaeocarpus japonicus Siebold et Zucc. | コバンモチ |
| Elaeocarpus zollingeri K.Koch | ホルトノキ |
| Enkianthus cernuus (Siebold et Zucc.) Makino f. rubens (Maxim.) Ohwi | ベニドウダン |
| Enkianthus perulatus (Miq.) C.K.Schneid. | ドウダンツツジ |
| Eriobotrya japonica (Thunb.) Lindl. | ビワ |
| Erythrina crista-galli L. | カイコウズ |
| Erythrina x bidwillii Lindl. | サンゴシトウ |
| Eucalyptus camaldulensis Dehnh. | セキザイユーカリ |
| Eucalyptus globula Labill. | ユーカリ |
| Eucalyptus robusta Sm. | オオバユーカリ |
| Eucommia ulmoides Oliv. | トチュウ |
| Euonymus alatus (Thunb.) Siebold f. alatus | ニシキギ |
| Euonymus alatus (Thunb.) Siebold var. alatus f. striatus (Thunb.) Makino | コマユミ |
| Euonymus japonicus Thunb. | マサキ |
| Euonymus oxyphyllus Miq. var. oxyphyllus | ツリバナ |
| Euonymus planipes (Koehne) Koehne | オオツリバナ |
| Euonymus sieboldianus Blume | マユミ |
| Euonymus sieboldianus Blume var. sanguineus Nakai | カントウマユミ |
| Euptelea polyandra Siebold et Zucc. | フサザクラ |
| Eurya emarginata (Thunb.) Makino | ハマヒサカキ |
| Eurya japonica Thunb. var. japonica | ヒサカキ |
| Exochorda racemosa (Lindl.) Rehder | リキュウバイ |
| Exochorda serratifolia S.Moore | ヤナギザクラ |